- Sąpłaty
- Sasek
- Sasek Mały
- Sasek Wielki
- Sędańsk
- sędrowo
- Siedliska
- Siódmak
- Śledzie
- Spaliny Małe
- Spaliny Wielkie
- Spychowo
- Stachy
- Stankowo
- Stare Czajki
- Stare Kiejkuty
- Stary Suchoros
- Suchorowiec
- Świętajno
- Szczepankowo
- Szklarnia
- Szuć
- Szymanki
- Szymany
- Sąkieły Małe
- Skalisze
- Skaliszki
- Sobiechy
- Stawki
- Stręgiel