S
- (Setomaa vald) Suur-Treski
- (Võru vald) Sooküla
- (Setomaa vald) Soelaane
- (Võru vald) Soe
- (Võru vald) Soe
- (Setomaa vald) Sesniki
- (Rõuge vald) Savimäe
- (Setomaa vald) Saatse
- (Rõuge vald) Sänna
- (Setomaa vald) Saabolda
- (Setomaa vald) Saarekula
- (Setomaa vald) Slobotka
- (Setomaa vald) Selise
- (Setomaa vald) Serga
- (Võru vald) Saarde
- (Võru vald) Sutte
- (Võru vald) Suuremetsa
- (Võru vald) Sika
- (Rõuge vald) Soodi
- (Rõuge vald) Suhka
- (Rõuge vald) Sarise
- (Rõuge vald) Soolätte
- (Rõuge vald) Sadrametsa
- (Antsla vald) Savilöövi
- (Rõuge vald) Singa
- (Rõuge vald) Sakurgi
- (Antsla vald) Soome
- (Antsla vald) Säre
- (Antsla vald) Sarapuu
- (Antsla vald) Saera